Obecność następujących rodzajów kryształów ma znaczenie w diagnostyce:

• kryształy cystyny- występują u chorych z cystynurią, będącą chorobą z wrodzonym defektem transportu cystyny, lizyny, argininy i ornityny w nabłonku jelit i cewek nerkowych
• kryształy tyrozyny - występują u chorych w ostrym zaniku miąższu wątroby
• kryształy leucyny - występują u chorych w ostrym zaniku miąższu wątroby
• kryształy ksantyny - występują u chorych z wrodzonym defektem przemiany kwasu moczowego spowodowanym niedoborem oksydazy ksantynowej
• kryształy leków - obecność tych kryształów świadczy o zażywaniu odpowiednich leków i może mieć duże znaczenei w diagnostyce np zatruć.
• kryształy fosforanu magnezowo-amonowego - występują w przypadku obecności w moczu drobnoustrojów rozkładających mocznik do amoniaku i dwutlenku węgla